Набор реагентов «Diaporthe helianthi-РВ»
Кат. № PH-047
Фомопсис подсолнечника – заболевание, широко распространенное во всех регионах возделывания этой культуры. Впервые это заболевание было обнаружено и описано в бывшей Югославии, где возбудитель был определен как Diaporthe helianthi Munt.-Cvetk., Mihaljc. & M. Petrov. Долгое время идентификацию этого вида проводили исключительно по симптомам и морфологическим признакам, однако было установлено что одно и тоже растение может быть поражено более чем одним видом рода Diaporthe. На сегодняшний день известно, что на подсолнечнике могут встречаться 13 видов рода Diaporthe.
В России первое обнаружение Diaporthe helianthi было в 1990 году в Ставропольском крае и со временем было зарегистрировано в других субъектах Российской Федерации. Данный патоген также был обнаружен в Болгарии, Германии, Венгрии, Франции, Хорватии, Чехии, Мексике, США, Аргентине, Марокко. В США и странах Европы потери урожая от заражения фомопсисом составили 30-40%.
Основные растения-хозяева – культурные и дикорастущие виды рода Helianthus, также патоген способен поражать такие растения как дурнишник обыкновенный (Xanthium strumarium), лопух большой (Arctium lappa), амброзия многолетняя (Ambrosia psilostachya).
Возбудитель фомопсиса подсолнечника может поражать все надземные части растения. Ранние симптомы включают появление коричневых пятен неправильной формы на кончиках листьев, которые разрастаются между жилками, что приводит к некрозу и гибели листа. Возбудитель начинает распространяться вдоль главной жилки к черешку. Дальше инфекция распространяется от черешка к стеблю, опоясывая его. Ядра у пораженных растений имеют коричневый окрас и легко отделяются от плодовой оболочки.
Возбудитель может передаваться зараженными семенами, а основным источником заражения являются растительные остатки, в которых патоген способен сохраняться до 5 лет.
На сегодняшний день Diaporthe helianthin включен во второй перечень карантинных вредных организмов, ограниченно распространенных на территории Евразийского экономического союза.
«ФИТОСКРИН» — технология быстрой молекулярно-генетической диагностики заболеваний растений методом ПЦР в реальном времени
«Diaporthe helianthi-РВ»
Набор реагентов для выявления ДНК возбудителя фомопсиса подсолнечника методом полимеразной цепной реакции в реальном времени
Набор реагентов «Diaporthe helianthi-РВ» предназначен для обнаружения ДНК Diaporthe helianthi – возбудителя фомопсиса подсолнечника.
Набор может быть использован в лабораторных центрах и институтах, проводящих контроль карантинного фитосанитарного состояния растений, в том числе посадочного материала в целях обнаружения ДНК Diaporthe helianthi. Набор позволяет качественно определить, содержится ли в образце ДНК Diaporthe helianthi.
Диагностика растений с помощью набора «Diaporthe helianthi-РВ» возможна на всех этапах его вегетационного развития методом полимеразной цепной реакции в реальном времени (ПЦР-РВ).
Набор реагентов «Diaporthe helianthi-РВ» позволяет одновременно выявлять в одной реакционной смеси специфичный фрагмент ДНК Diaporthe helianthi (по каналу флуоресценции FAM/Green), а также внутренний положительный контроль – по каналу флуоресценции R6G/HEX/Yellow/VIC). Вторая реакция – ВПК (Внутреннего Положительного Контроля) – необходима для исключения ложноотрицательных результатов.
- Чувствительность
Чувствительность ПЦР при использовании набора реагентов «Diaporthe helianthi-РВ» не менее 1,0*103 копий ДНК в миллилитре пробы.
- Специфичность
Специфичность – ложноотрицательные результаты при анализе образцов растений, содержащих ДНК Diaporthe helianthi, отсутствовали, ложноположительные результаты при анализе образцов ДНК растений и ДНК бактерий, не содержащих Diaporthe helianthi, отсутствовали.
Набор реагентов апробирован на следующих приборах: «АНК-32 (32М, 48)» (ИАП РАН, г. Санкт-Петербург, Россия), «CFX-96» («BioRad», США), «Rotor Gene Q/6000» (Qiagen/Corbett, США/Австралия), «DT» («ДНК-технология», Россия), QuantStudio 5 (Thermo Fisher Scientific, США).
