Набор реагентов "Stenocarpella maydis - РВ"
Stenocarpella maydis способен зимовать на растительных остатках кукурузы в виде пикнид и мицелия. Кроме того, существуют данные о том, что патоген может сохраняться в почве. Основной способ распространения – инфицированные семена кукурузы, в том числе и предназначенные для корма скота. Естественное распространение патогена сильно ограничено, однако, мицелий и пикниды гриба, содержавшиеся в растительных остатках, могут распространяться с сельскохозяйственной техникой и инфицировать другие субстраты.
Stenocarpella maydis сложно идентифицировать полагаясь на внешнюю симптоматику, поскольку схожие симптомы характерны для близкородственного гриба - S. macrospora и некоторых других патогенов, инфицирующих кукурузу.
«Stenocarpella maydis- РВ»
Набор реагентов для выявления ДНК Stenocarpella maydis методом полимеразной цепной реакции в реальном времени
Набор реагентов «Stenocarpella maydis - РВ» позволяет одновременно выявлять в одной реакционной смеси специфичный фрагмент ДНК Stenocarpella maydis – по каналу флуоресценции FAM/Green, а также внутренний положительный контроль (ВПК) – по каналу флуоресценции R6G/HEX/Yellow/VIC. Реакция ВПК необходима для исключения ложноотрицательных результатов.
- Чувствительность
Для испытания аналитической чувствительности набора был произведен ряд из 7-ми разведений полученной ДНК изолята средней зараженности (19,2 ct). Положительная реакция наблюдалась при разведении исходного инокулюма в 105 раз. При разведении в 106 реакция была нестабильной. При разведении в 107 раз специфичной реакции не отмечено
- Специфичность
Специфичность – ложноотрицательные результаты при анализе образцов, содержащих ДНК целевого объекта, отсутствовали, ложноположительные результаты при анализе образцов ДНК, не содержащих вышеперечисленные специфические фрагменты, отсутствовали.
Набор реагентов апробирован на следующих приборах: Gentier 96Е (Tianlong, Китай), QuantStudio 5 (Thermo Fisher Scientific, США), «CFX96» («BioRad», США), «DT» («ДНК-технология», Россия), «Rotor Gene» (Qiagen), «АНК-32 (32М, 48)» (ИАП РАН, г. Санкт-Петербург, Россия)
Примеры анализа с использованием Набор реагентов "Stenocarpella maydis - РВ" на приборах для ПЦР в реальном времени:
Вернуться в раздел