Набор реагентов «STAGONOSPOROPSIS ANDIGENA-РВ»
Кат. № PH-052
Stagonosporopsis andigena (Turkenst.) Aveskamp, Gruyter & Verkley – фитопатогенный гриб семейства Didymellaceae, возбудитель фомозной пятнистости листьев картофеля. Впервые был описан Turkensteen как Phoma andina, но позже был переименован в Phoma andigena. На основании морфологии и филогенетических анализов реклассифицирован как S. andigena в 2010 г (EFSA Panel on Plant Health, 2018:16(10)).
S. andigena – аборигенный вид, распространенный на территории Анд Южной Америки. По сообщениям ЕОКЗР, также присутствует в Боливии и Перу. Внесен ЕОКЗР в список карантинных вредных организмов категории А1 и является потенциально опасным патогеном для картофелеводческих регионов.
Основным растением-хозяином S. andigena является картофель, кроме того, фитопатоген способен поражать и другие клубнеобразующие растения рода Solanum, чаще всего это S. phureja, S. goniocalyx, S. medians и некоторые другие пасленовые дикорастущие и сорные растения. По некоторым сообщениям томат (S. lycopersicum) был зарегистрирован как растение-хозяин S. andigena, однако эти данные не получили достоверного подтверждения. Вероятно, в этом исследовании шла речь о близкородственном фитопатогенном грибе S. crystalliniformis, поражающий как томаты, так и картофель (EFSA Panel on Plant Health, 2018:16(10)).
S. andigena трудно идентифицировать исключительно на основе морфологии патогена, ассоциации с растением-хозяином, проявлении симптомов у зараженных растений. Подобные внешние симптомы заражения характерны для других фитопатогенных грибов, поражающих картофель (например, Alternaria solani), при этом морфология пикнид и пикнидиоспор сходна другими близкородственными таксонами.
S. andigena поражает листья, стебли и черешки растений картофеля: на листьях появляются концентрические поражения, обычно черного цвета. На ранних стадиях инфекция затрагивает старые листья, по мере прогрессирования распространяется далее, при этом многочисленные поражения могут сливаться и увеличиваться в размерах. Листовая пластина больных растений выглядит обожженной. Существуют данные о том, что S. andigena не поражает подземные части растений (Turkensteen LJ, 1978).
Возбудитель способен сохраняться в растительных остатках и почве, образовывая при этом пикниды с пикнидиоспорами. Благоприятными условиями для инфицирования являются температурный режим ниже 15 °С и высокая влажность. Листья картофеля заражаются пикнидиоспорами, распространению которых способствуют дожди или проводимые ирригационные мероприятия.
«ФИТОСКРИН» — технология быстрой молекулярно-генетической диагностики заболеваний растений методом ПЦР в реальном времени
«Stagonosporopsis andigena -РВ»
Набор реагентов для выявления ДНК возбудителя фомозной пятнистости листьев картофеля полимеразной цепной реакции в реальном времени.
Набор может быть использован в лабораторных центрах и институтах, проводящих контроль фитосанитарного состояния растений, в том числе посадочного материала в целях обнаружения Stagonosporopsis andigena. Набор позволяет качественно определить, содержится ли в образце ДНК Stagonosporopsis andigena.
Набор реагентов «Stagonosporopsis andigena-РВ» позволяет одновременно выявлять в одной реакционной смеси специфичный фрагмент ДНК Stagonosporopsis andigena – по каналу флуоресценции FAM/Green, а также внутренний положительный контроль (ВПК) – по каналу флуоресценции R6G/HEX/Yellow/VIС. Реакция ВПК необходима для исключения ложноотрицательных результатов.
- Чувствительность
Чувствительность ПЦР при использовании набора реагентов «Stagonosporopsis andigena-РВ» не менее 2,0*103 копий ДНК в миллилитре пробы.
- Специфичность
Ложноотрицательные результаты при анализе образцов, содержащих ДНК целевого объекта, отсутствовали, ложноположительные результаты при анализе образцов ДНК, не содержащих специфические фрагменты ДНК Stagonosporopsis andigena отсутствовали.
Набор реагентов апробирован на следующих приборах: «АНК-32 (32М, 48)» (ИАП РАН, г. Санкт-Петербург, Россия), «CFX96» («BioRad», США), «Rotor Gene» (Qiagen), «DT» («ДНК-технология», Россия), QuantStudio 5 (Thermo Fisher Scientific, США).
